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高福团队《柳叶刀》发文,分析北京新发病例基因组:中国近期疫情未见新变异株

2024-06-20 10:17:19      点击:094
原标题:高福团队《柳叶刀》发文,高福分析北京新发病例基因组:中国近期疫情未见新变异株

中国进一步优化新冠疫情防控措施后,团队出现病例数量激增,柳叶例基也引发了人们对可能出现新变异株的文分担忧。北京时间2月9日7:30分,析北新变《柳叶刀》(the lancet)发表来自中国科学院微生物研究所高福教授团队的京新近期最新研究成果。

作为这项研究的发病通讯作者,高福说:鉴于变异株对疫情进程的因组疫情异株影响,有必要调查中国近期调整covid-19防控政策后是中国否出现新的变异株。解放日报·上观新闻记者了解到,高福他们针对北京地区新冠病毒感染病例的团队分析表明,中国近期疫情中未见新的柳叶例基covid-19变异株。

在covid-19被宣布为全球大流行后的文分3年时间内,阿尔法(alpha)、析北新变贝塔(beta)、京新近期伽马(gamma)、德尔塔(delta)和奥密克戎(omicron)等变异株陆续出现,在全球范围内引起多轮传播。2019年12月以来,高福院士等此项最新研究的作者,定期收集北京地区输入型病例和本地covid-19病例的呼吸道样本,并随机选择样本进行分析。

在中国逐步调整最严格的大流行管控政策后,高福团队抽样北京地区covid-19感染新发病例进行了基因组分析,结果表明所有病例均由现有毒株引起。发表于《柳叶刀》的研究表明,在2022年11月14日至12月20日期间,超过90%的本地感染病例涉及北京优势毒株中的两种现有奥密克戎变异株亚分支——ba.5.2和bf.7。作者表示,由于北京人口的特点以及高传染性covid-19毒株在北京地区的传播情况,这些研究发现可被视为中国疫情现状的缩影。

具体而言,他们使用快速、大规模测序技术生成基因组序列,并使用现有的高质量covid-19序列分析其进化历程和种群动态。此项研究共纳入2881个高质量序列,其中境外输入型病例来自63个国家和地区。在感染病例数量开始急剧增加至12月中旬,随机选择了413个新样本进行测序。其中350例为本地病例,63例为输入型病例。

对这400多个新序列的分析表明,其均属于现有已知的covid-19毒株。其中,2022年11月14日之后,北京地区的优势毒株为bf.7,占本地感染病例的75.7%;另一种奥密克戎变异株亚分支ba5.2,则占本地感染病例的16.3%。其中,ba.5.2有效种群大小在2022年11月14日至25日之间无显著变化,但在2022年11月30日前后急剧增加;bf.7的种群大小则自11月14日起便逐渐增加。

高福表示,其团队分析表明,两种已知的奥密克戎变异株亚分支,而非任何新的变异株,是北京地区当前病例数激增的主要原因,而且放眼整个中国,可能同样适用。然而,随着covid-19在中国的大规模传播,我们有必要继续密切监测疫情,以便尽早发现可能出现的任何新变异株。作者承认研究存在一些局限性:由于大规模病毒检测结束,真实感染病例数被低估,导致数据中存在一定程度的抽样偏倚。因此,需要更多的样本来研究奥密克戎变异株亚分支的传播性和致病性。

我们很高兴看到来自中国的这些急需的数据。令人欣慰的是,该研究并未发现关于新变异株的证据,但这一结果也并非在意料之外。南非斯坦陵布什大学(university of stellenbosch)的wolfgang preiser教授和tongai maponga博士在文章相关评论中表示,根据北京地区的数据得出全国情况的结论时仍需谨慎。他们审慎提出:对于一个幅员辽阔、人口稠密的大国,在中国的其他地区,可能会出现其他进化动态,其中可能包括可被人类感染且进一步进化后发生‘回溢’(spill back)的动物病毒。

本文作者:徐瑞哲

题图来源:新华社

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